FOREDRAG

Vekselvirkning mellem medicin og protein-receptorer

Vekselvirkning mellem medicin og protein-receptorer

En af de essentielle processer i molekylær biologi er ligand-protein interaktion og association til receptorer i og på celler. Af berømte ligand-receptor komplekser er foreksempel acetylcholin-receptor
som spiller en stor rolle i signal-overføring og hvis udeblivelse ses i demens sygdomme. Elektroniske strukturer spiller en stor rolle for beregning af disse bindings og signal processer og for at kunne
rekonstruere de elektroniske strukturer skal store kvante mekaniske computerberegninger køres, og som kan give en vigtig forståelse for protein processerne. Vi skal dog udover disse store beregninger bruge differential geometriske og topologiske metoder for at forstå den vigtige del af processen værende molekylær genkendelse og molekylær tilvirkning.
Proceduren er: Når molekylernes bestandele er bestemt bygges de op i kemi-programmer og derefter køres en stor kvante mekanisk simulering (optimering) af komplekset ofte med klassisk mekanik udenfor det aktive site, som behandles kvantisk. Derefter konstrueres fladerne ud fra optimerede protein koordinater
og triangularisering og elektro-statiske og andre implicite iso-potential-flader konstrueres. Disse giver et stort indblik i molekyle-receptor vekselvirkning og har vist sig at være til stor hjælp for medicin-receptor “fitning” i den bioteknologiske industri (e.g. Santaris A/S, Novo-Nordisk A/S etc).

Infoboks:

Vekselvirkning mellem medicin og protein-receptorer

Dato: 21. Oct 2013
Tidspunkt: 19:30:00

Foredragsholder: Lektor Henrik Bohr
Institution: DTU Fysik
Mailadresse:

Foredraget afholdes: Geologisk Museum

Bemærkninger: